Se o INSS pediu c;opia do livro de registro de empregados é pq não tem os dados no sistema e esse é o meio mais fácil de provar, ele pode verificar no ministério do trabalho se há algum dado dele lá. O FGTS ele tem que verificar na CTPS em que banco foi depositado e solicitar extrato lá, se o banco não existe deve saber quem comprou e providenciar o extrato. A CEF só tem extrato a partir da centralização das contas.
A empresa pode verificar na contabilidade se há algum tipo de lançamento em nome dele, se ele não conseguir nada, só resta arrumar testemunha e partir para a via judicial.